BCMB2002 Lecture Notes - Lecture 3: Proline, Acid Hydrolysis, Hydrolysis

• School: University of Sydney
• Department: Molecular Biology
• Course: BCMB2002
• Professor: bcmb2002

Document Summary

Le(cid:272)tu(cid:396)e (cid:1007): glo(cid:271)ula(cid:396) a(cid:374)d fi(cid:271)(cid:396)ous p(cid:396)otei(cid:374)s; peptide se(cid:395)ue(cid:374)(cid:272)i(cid:374)g. I(cid:271)o(cid:374)u(cid:272)lease: s(cid:373)all p(cid:396)otei(cid:374) that (cid:272)o(cid:374)tai(cid:374)s (cid:1012) (cid:272)(cid:455)stei(cid:374)es li(cid:374)ked (cid:448)ia (cid:1008) disulfide (cid:271)o(cid:374)ds. U(cid:396)ea + (cid:1006)-(cid:373)e(cid:396)(cid:272)aptoetha(cid:374)ol = full(cid:455) de(cid:374)atu(cid:396)es (cid:396)i(cid:271)o(cid:374)u(cid:272)lease. Whe(cid:374) u(cid:396)ea & (cid:1006)-(cid:373)e(cid:396)(cid:272)aptoetha(cid:374)ol (cid:396)e(cid:373)o(cid:448)ed, p(cid:396)otei(cid:374) spo(cid:374)ta(cid:374)eousl(cid:455) (cid:396)efolds & the (cid:272)o(cid:396)(cid:396)e(cid:272)t disulphide (cid:271)o(cid:374)ds a(cid:396)e (cid:396)efo(cid:396)(cid:373)ed. Le(cid:448)i(cid:374)thal"s parado(cid:454): (cid:373)athe(cid:373)ati(cid:272)all(cid:455) i(cid:373)possi(cid:271)le fo(cid:396) p(cid:396)otei(cid:374) foldi(cid:374)g to o(cid:272)(cid:272)u(cid:396) (cid:271)(cid:455) (cid:396)a(cid:374)do(cid:373)l(cid:455) t(cid:396)(cid:455)i(cid:374)g e(cid:448)e(cid:396)(cid:455) (cid:272)o(cid:374)fo(cid:396)(cid:373)atio(cid:374) u(cid:374)til lo(cid:449)est- e(cid:374)e(cid:396)g(cid:455) is fou(cid:374)d. But its possi(cid:271)le (cid:271)(cid:272) sea(cid:396)(cid:272)h fo(cid:396) (cid:373)i(cid:374). e(cid:374)e(cid:396)g(cid:455) is not (cid:396)a(cid:374)do(cid:373) --- dire(cid:272)tio(cid:374) to(cid:449)ard the (cid:374)ati(cid:448)e stru(cid:272)ture is ther(cid:373)od(cid:455)(cid:374)a(cid:373)i(cid:272)all(cid:455) (cid:373)ost fa(cid:448)oura(cid:271)le. As p(cid:396)otei(cid:374) folds, it falls do(cid:449)(cid:374) the (cid:449)all of e(cid:374)e(cid:396)g(cid:455) fu(cid:374)(cid:374)el to (cid:373)o(cid:396)e sta(cid:271)le (cid:272)o(cid:374)fo(cid:396)(cid:373)atio(cid:374)s. Nati(cid:448)e, folded st(cid:396)u(cid:272)tu(cid:396)e is at the (cid:271)otto(cid:373) P(cid:396)otei(cid:374)s fold i(cid:374)to (cid:1006) a(cid:374)d (cid:1007) st(cid:396)u(cid:272)tu(cid:396)es that possess the lo(cid:449)est possi(cid:271)le f(cid:396)ee e(cid:374)e(cid:396)g(cid:455) Peptide (cid:272)hai(cid:374)s satisf(cid:455) the (cid:272)o(cid:374)st(cid:396)ai(cid:374)ts i(cid:374)he(cid:396)e(cid:374)t i(cid:374) thei(cid:396) o(cid:449)(cid:374) st(cid:396)u(cid:272)tu(cid:396)e (cid:894) a(cid:373)a(cid:272)ha(cid:374)d(cid:396)a(cid:374) plot(cid:895) Peptide (cid:272)hai(cid:374) (cid:373)ust fold to (cid:858)(cid:271)u(cid:396)(cid:455)(cid:859) (cid:373)ost of the h(cid:455)d(cid:396)opho(cid:271)i(cid:272) side (cid:272)hai(cid:374)s, (cid:373)i(cid:374)i(cid:373)izi(cid:374)g thei(cid:396) (cid:272)o(cid:374)ta(cid:272)t (cid:449)ith (cid:449)ate(cid:396) (cid:396)esidues (cid:894)val, leu, ile, met, phe(cid:895)