Class Notes (839,091)
Canada (511,184)
BIOL107 (256)
Lecture 15

BIO 207 LECTURE 15.docx

5 Pages
86 Views

Department
Biology (Biological Sciences)
Course Code
BIOL107
Professor
Lesley Harrington

This preview shows pages 1 and half of page 2. Sign up to view the full 5 pages of the document.
Description
Lec15 BIOL207 2014­02­10 Population genetics cont’d A.  Does recessive mean rare? (e.g. wrong answers to Midterm Question C2) NO !!!  e.g. rare, dominant (AD, XD) diseases in humans… e.g. O blood type is most common and is homozygous recessive True: (1) mutations are rare (2) most mutations are recessive …  … but this does not mean that mutations are recessive because they are rare (or vice  versa). B.  Hardy Weinberg Equilibrium (review) If population is in HWE (5 conditions: no selection, migration, mutation; random mating;  large population  2 2 size), then observed genotypic frequencies will match expectations  calculated as p , 2pq,  q . C.  Are all populations in HWE ?   NO !!!  But they are often close; even for 2umans, for a rare recessive disease can  estimate the  frequency of carriers based on number affected = q Another example to demonstrate HWE is for sickle cell anemia; if you are homozygote for a particular polymorphism  and have a defective allele, you will get a sickle shaped cell instead of a round cell; this cell will cause circulation +  clotting issues; the sickle cell allele is actually most common Africa and India; why is this allele really common in  these population? ▯ These  countries ten to have a great deal of malaria; this is where the sickle cell allele is in  higher frequency since the heterozygotes for sickle cell actually have a higher resistance to the malaria virus; useful  in areas. Allele frequencies wont change once these conditions are made; but once this new equilibrium is met, it  stays there ▯ HWE WILL BE MET! Two populations (India and Africa) will have different frequencies of sickle cell  allele even though they will remain constant themselves ▯ once the equilibrium is established, it wont change.  D.  Can one locus be in HWE and the other not?   YES !!!  e.g. there can be random mating in a large population with no migration, but  selection could  affect the frequency of alleles at one locus, but not another Things like large populations with random mathing and no migration; if you have migration, one allele can be in HWE  when others are not. Selection works at the gene level, not the individual level. You can be out of HWE for some  genes and in HWE for other genes all within the same population.  E.  How about those cats? … 99 “real” cats described in survey; raw data is on e­class White locus  5 pure white (W_) 94 not pure white (ww) Long locus 78 short (L_) 21 long (ll) Dilute locus 64 not dilute (D_) 35 dilute (dd) Piebald spotting     s                               S                               total alleles  41 0% white (ss) 2 × 41 0 2 × 41 39 0% to 50% white (Ss) 1 × 39 1 × 39 2 × 39 19 >50% white fur (SS) 0 2 × 19 2 × 19 TOTAL 121 77 198 p = 121/198 = 0.61 q =  77/198  = 0.39 2 2 p = 0.61 = 0.37 2pq = 2(0.61)(0.39) = 0.48 q2 = 0.392 = 0.15 expected if HWE observed  0.37 × 99 cats  =  36 (ss) 41 no white 0.48 × 99 cats  =  48 (Ss) 39 part white 0.15 × 99 cats  =  15 (SS) 19 mostly white … Orange/Tortoiseshell                                                 total alleles 5 orange female (X X )O 2 × 5 0 2 × 5 O o 22 tortoiseshell female (X X ) 1 × 22 1 × 22 2 × 22 30 black female (X X ) 0 2 × 30 2 × 30 8 orange male (X Y) 1 × 8 0 1 × 8 o 30 black male (X Y) 0 1 × 30 1 × 30 4 tortoiseshell male (???) ­­ ­­ ­­ TOTAL 40 112 152 p=112/15
More Less
Unlock Document

Only pages 1 and half of page 2 are available for preview. Some parts have been intentionally blurred.

Unlock Document
You're Reading a Preview

Unlock to view full version

Unlock Document

Log In


OR

Join OneClass

Access over 10 million pages of study
documents for 1.3 million courses.

Sign up

Join to view


OR

By registering, I agree to the Terms and Privacy Policies
Already have an account?
Just a few more details

So we can recommend you notes for your school.

Reset Password

Please enter below the email address you registered with and we will send you a link to reset your password.

Add your courses

Get notes from the top students in your class.


Submit