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Lecture 7

Lecture 7 – Understanding Mutations-2.docx

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Biology 2581B

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Lecture 7 – Understanding Mutations January 30, 2014 Mutation­ change in DNA sequence that can be inherited Mutant­ an organism that experiences a change in DNA sequence These are yeast colonies The ones that are growing on the medium that is  lacking must have a mutation that allows them to do  this­ they are mutants Wild Type­ considered to be the norm, is more frequent, and was displayed “first”. The  mutant will show a negative effect if there is one. Is a mutation good or bad? It depends: • Most mutations don’t have any effect • Can cause neutral changes • Very few are beneficial • Some cause problems • Some are lethal • There can be a whole gradient on how the mutation can effect you • Some mutations will be more detrimental or beneficial in one environment than in  another Mutations will show up in the phenotype­ there is an altered appearance, growth  condition, behaviour, or molecule. It’s something you can track. Types of Mutations Small Changes­ based on nucleotide base pair substitutions You always have to consider it affects both sides of the DNA strand­ on each  side one nucleotide changes Base Pair Substitutions­ changes are notated in different ways­ these are all showing the same change Transitions­the purine is replaced by a purine; the  pyrimidine is replaced by a pyrimidine Transversion­ the purine is replaced by a pyrimidine; the  pyrimidine is replaced by a purine Small Changes­based on nucleotide insertions­ the  addition of one or more nucleotide pairs Small Changes­ based on nucleotide deletions­ a block of one  or  more nucleotide pairs is lost from a DNA molecule Small Changes­ based on nucleotide inversions • Reverse compliments­ you have to turn it  around and flip it over Small Changes­based on nucleotides translocation • Move something somewhere else Large Changes­ affecting chromosomes or parts of chromosomes Chromosome rearrangement­  mutations can occur at the base level  or at the chromosome or genome level Mutations are: • Rare events­ 2­12 X 10  per  gene per gamete. They are gene dependent • Can happen all the time • Completely random • Have many different reasons: errors during replication, radicals, UV damage NOTE: larger genes are larger targets that sustain more mutations Are mutations in response to an environmental stimulus or do they happen randomly? In the 50’s there was a famous set of experiments to see whether mutations were random  or they happened because of environmental stimulus. They exposed bacteria to the  stimulus penicillin. They knew that if the stimulus was responsible for the mutation then  all of the bacteria would have a similar number of mutations, but if they happen randomly  then they would have different number of mutations. They found that the bacteria cultures varied in whether or not they had mutations and the  number of mutations they had Fluctuation Test Results­ Max Delbruck, Salvador Luria, Alfred Hershey You do this by plating­ pour the bacteria from the test tube onto a plate and note how  many are growing. Some plates had no mutations, some had a few and some had many Using Replica Plating It’s always the same  colonies that are able to  grow and the same 
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