Class Notes (836,495)
Canada (509,829)
Biology (6,816)
Prof (12)
Lecture 2

Lecture 2 – DNA.docx

5 Pages
94 Views
Unlock Document

Department
Biology
Course
Biology 2581B
Professor
Prof
Semester
Winter

Description
Lecture 2 – DNA, the Molecule of Heredity and Biological Information What is information? • A message received and understood • Knowledge acquired through study of experience or instruction • Facts, concepts, or instructions; any sort of knowledge or supposition which can  be communicated • Information is the result of processing, manipulating, and organizing data in a  way that adds to the knowledge of the receiver How much info is in a DNA sequence, a gene, a genome? The gene coding for insulin: • Coding sequence comprises 1789 bp • Codes for a hormone • Secreted by islet cells in the pancreas • Important in maintaining blood glucose levels Consider a Simple Gene… Out unknown: a number between 1 and 100 Data can only be generated by asking, “is the number higher/lower than x” • ROUND #1: is the number higher than 10? YES GOT INFO • ROUND #2: is the number higher than 0? YES DIDN’T GET INFO • ROUND #3: is the number higher than 5? YES DIDN’T GET INFO • ROUND #4: is the number higher than 50? YES GOT INFO Information is “that which reduces uncertainty” Consider the Following Hypothetical Devices Quantitating Information Uncertainty = log2(M), where M is the # of possible symbols Example: device #3 Uncertainty = log (4) = 2 bits 2 How much information could device #3 generate? It depends on the length of the sequence Maximum information content of any sequence = L[log (M)],2where L is the length of the  sequence For DNA: 4 possible symbols A, G, C, T Uncertainty = log 24) = 2 bits For the insulin gene, the information content is: 1789[log 24)] = 3578 bits NOTE: these calculations assume an equal probability (0.25) of seeing each  symbol in the sequence Why Bits? If you were to unambiguously convert a DNA sequence into a string of 1’s and 0’s you  would need, on average, 2 bits/symbol 00 – A 01 – G 10 – C 11 – T 000110101011  ▯AGCCCT Thus a DNA sequence has the capacity to store information… but can this property  be shown experimentally? Fred Griffith was looking at the Streptococcus pneumoniae bacteria and noticed there  were two different types of colonies that could emerge – smooth and rough The smooth colonies were virulent and the rough were avirulent Controls: 1. S was injected into mouse and the mouse got pneumonia and dies 2. R is isolated and injected into mouse  and the mouse is fine 3. The S form is killed with heat  leaving cellular debris that is injected  into the mouse and the mouse is fine. The unusual observation is that when the  heat killed S cells and the R cells are mixed  and injected into the mouse the mouse dies.  When tissue is analyzed its found that S  forms bacteria that is alive­ somehow the  heat killed S got some of its biological  information into the live R cells converting  them to S cells and killing the mouse DNA Carries Biological Information Oswald Avery 1930­1940 Showed that the transfer of information was independent of the mouse, you don’t need  the mouse 
More Less

Related notes for Biology 2581B

Log In


OR

Join OneClass

Access over 10 million pages of study
documents for 1.3 million courses.

Sign up

Join to view


OR

By registering, I agree to the Terms and Privacy Policies
Already have an account?
Just a few more details

So we can recommend you notes for your school.

Reset Password

Please enter below the email address you registered with and we will send you a link to reset your password.

Add your courses

Get notes from the top students in your class.


Submit