Class Notes (836,363)
United States (324,475)
Biology (619)
BIOL 2324 (9)
Lecture

SDS-PAGE.doc

5 Pages
96 Views
Unlock Document

Department
Biology
Course
BIOL 2324
Professor
Thomas Manning
Semester
Fall

Description
Melissa Johnson                           Lab: Monday  2:50pm TA: Manasa Madasu                     November 15, 2010 Separating proteins from a complex mixture by  SDS­Ployacrimide Gel Electrophoresis (SDS­PAGE) Results Figure 1. Sketch of what the gel would have looked like in ideal conditions if it had run correctly and the  distances traveled by each unknown protein. Figure 2. Standard Curve of known protein distances traveled vs. log molecular weight. Table 1.  Standard protein sizes and distances traveled Standard  Distance (cm) Size (kD) 1.1 250 1.3 150 1.6 100 2.4 75 2.8 50 3.8 25 Table 2.  Unknown distances traveled and estimated sizes Distance (cm) Size (kD) BSA 1.2 176.6200486 2 95.4992586 B­Gal 2.1 88.4341488 Catalase 2.2 81.89172135 Calculations for unknown: Equation from standard curve: y= ­0.3338x +2.6476 BSA had bands at 1.2cm and 2cm Y=log^10(((­0.3338)*1.2)+2.6476) = 176.6 kD Y=log^10(((­0.3338)*2)+2.6476) = 95.5 kD B­Gal had a band at 2.1cm Y=log^10(((­0.3338)*2.1)+2.6476) = 88.4 kD Catalase had a band at 2.2cm Y=log^10(((­0.3338)*2.2)+2.6476) = 81.9 kD Discussion This laboratory was desgined to give a broad look at one of the methods of separating proteins.  We have already studied agarose gel electrophoresis as a method of separating proteins on the basis of  size and charge.  SDS­PAGE is a method of separating proteins only on the basis of molecular weight.   SDS­PAGE stands for SDS­Ployacrylamide Gel Electrophoresis.  SDS is sodium dodecyl sulfate, which  is a detergent that renders the charge of the protein in question insignificant by coating it in negatively  charged sulfate groups.    When a current is applied to the gel, the negatively charged molecules migrant  toward the positive pole.  The polyacrylamide gel matrix retards larger molecules, while smaller  molecules can travel further. 1 The unknown proteins used in this laboratory were bovine serum albumin (BSA), B­ Glactosidase, and Catalase.  Bovine serum albumin is a protein with many applications across  biochemical research.  This protein has 607 amino acid residues and is very stable, reacting in very few  biochemical reactions.  It is also used frequently due to its low cost, as it is easily separated from bovine  blood.  These properties make it ideal in the study of biochemical processes.  BSA also makes up part of  3 the composition of whey, which can be used as a dietary protein supplement.   Beta­Galactos
More Less

Related notes for BIOL 2324

Log In


OR

Join OneClass

Access over 10 million pages of study
documents for 1.3 million courses.

Sign up

Join to view


OR

By registering, I agree to the Terms and Privacy Policies
Already have an account?
Just a few more details

So we can recommend you notes for your school.

Reset Password

Please enter below the email address you registered with and we will send you a link to reset your password.

Add your courses

Get notes from the top students in your class.


Submit