BIOL 202 Study Guide - Genotyping, Restriction Fragment Length Polymorphism, Circulatory System
19 views11 pages
22 Apr 2012
School
Department
Course
Professor
!"#$%&%#%&'()*($(%&+,-)
• Polygenic-)%.#&%,)&$/0"($+(1)23)4"0%&50()6($(,7)","#003)&$/0"($+(1)23)
($'&.8$4($%#0)+8$1&%&8$,9):;&,)%35&+#003)0(#1,)%8)+8$%&$"8",)'#.&#%&8$)&$)%;()
%.#&%9)
• Remember:)<($1(0&#$)6($(,),%&00)1.&'()="#$%&%#%&'()%.#&%,9)
)
Environmental3Effects:3Genotype3NOT3EQUAL3to3the3Phenotype)
>8")4&6;%)1&//(.)/.84)#);(%(.8?368",)&$1&'&1"#0)#$1)#);848?368",)&$1&'&1"#0)&/)38")
#.()@A@7)2"%)$8%)#00)8/)38".)5;($8%35(,)#.()&1($%&+#0)B)%;()+#$)2()#$3C;(.()&$)
2(%C(($9):;(,()4#3)2()($'&.8$4($%#0)(//(+%,)%;#%)&$1"+()C.&D0&$(,,)&$)%;#%)5(#)%8)
6&'()#)1&,%.&2"%&8$)8/)C.&$D0(,9))
)
<#E8.)($'&.8$4($%#0)(//(+%,)8$);8C)4"+;)38")(#%)/8.)(F#450(9)
)
Mean3Vs.3Variance:)
Mean)G)#'(.#6()H;&6;(,%)5(#D)&$)%;()4&110(I)
Variance)G);8C)'#.()%;(3)#.(9))J)G)KKA)L)G)M)HN&)O)PQI)A)L)
)
R#+;)&$1&'&1"#0S,)'#0"()HN&I7)#$1),"2%.#+%)%;()4(#$)'#0"()8/)%;()585"0#%&8$)HPI)/.84)
&%)H1('&#%&8$)/.84)%;()#'(.#6(I9)K="#.()%;()1('&#%&8$)HPQI)#$1)1&'&1()23)LT<URV)WX)
YLZYJYZT@[K)HLI9)
)
J\)G)%8%#0)phenotypic)'#.&#$+()
• J*)G)genetic)'#.&#$+()H1&'&1(1)&$%8)]),"2+#%(68.&(,I)
o J@)G)additive)6($(%&+)'#.&#$+(7)D(3)/8.)1(%(.4&$&$6)1&.(+%).(,(420#$+()
8$)#'(.#6()2(%C(($)5#.($%,)#$1)8//,5.&$69)
o JZ)G)dominance3'#.&#$+(7)1&//(.($%)#00(0(,)&$%(.#+%)#%)#)6&'($)08+",9)W$()
2(&$6)184&$#$%)8'(.)%;()8%;(.9)
o JY)G)epistatic3'#.&#$+(7)&$%(.#+%&8$)2(%C(($)1&//(.($%)#00(0(,)#%)1&//(.($%)
08+&)C&%;)(#+;)8%;(.9)
)
• R$'&.8$4($%#0)J#.&#$+()
o J<)G)maternal)(//(+%,)'#.&#$+(7)&/)48%;(.);#1)6881)$"%.&%&8$)C;&0()38")
C(.()&$)%;()C8427)38")C8"01);#'()#)1&//(.($%)5;($8%35()%;#$)&/)38");#1)
588.)$"%.&%&8$9)RF9)1.&$D&$67)1."6,999)
o JR))G)pure)environmental3'#.&#$+(7)+;&01)28.$)&$)#)+801(.)8.)C#.4(.)
+0&4#%(9)W.)48.(),"$$3A0(,,),"$$39)^;#$6()%;(&.);#&.)+808".)8.),D&$)
+808".)
VP3=3VM3+3VE3+3VD3+3VI3+3VA3
)
Additive3genetic3variance3(VA):3'#.&#$+()#48$6)&$1&'&1"#0,)1"()%8)#11&%&'()(//(+%,)
8/)#00(0(,)#$1)6($(,)
• W$()585"0#%&8$-)L8)&$%(.#+%&8$)2(%C(($)%;()%C8)#00(0(,)H@)#$1)#I7)38")E",%)
#11)"5)%;()(//(+%,)H@#I9)
• :C8)585"0#%&8$,-)\".()_)#$1)\".()Q7)6($(,)%;#%)1(%(.4&$()%;()1&//(.($+(,)#.()
#11&%&'(,7);32.&1,),;8"01)2()#$)&$%(.4(1&#%()8/)%;()%C8)5;($8%35(,9)
O J@)&,)5#.%&+"0#.03)&458.%#$%)2(+#",()&%)1(%(.4&$(,)%;()1(6.(()%8)C;&+;)
.(0#%&'(,).(,(420()(#+;)8%;(.9)
O RF#450(-)[#D()#$1)Y$0(%)HK%.(#4I)K%&+D0(2#+D,9)`32.&1,)&$)%;()4&110()8/)6&00)
.#D(.,)#$1)2813)1(5%;9)
Dominance3variance3(VD):3'#.&#$+()#48$6)&$1&'&1"#0,)1"()%8)184&$#$+()(//(+%,)
2(%C(($)#00(0(,)
O @,,"4()%;#%)@)&,)+8450(%(03)184&$#$%)8'(.)#9)W.)+.8,,&$6)Q)\".()2.((1,)#,)
2(/8.(9):;();32.&1A@#)C&00)088D)0&D()%;()184&$#$%)5;($8%35(9)
)
^#$)4#D();32.&1)a2#+DO+.8,,(,b)%8)%;()5#.($%#0)/8.49)Y/)%;()differences3are3
additive7)5;($8%35(,),;8"01)2()proportional-to-the-amount-of-the-genome-
originating-from-each-group9)Y/)&%)1('&#%(,)/.84)%;()0&$(7)the3differences3are3
dominant-)
_9 ^.8,,)\".():35()_)C&%;)#)\".():35()Q)).(,"0%,)&$)\".()_7)\".()Q7)8.)X_)
;32.&1)
Q9 ^.8,,)\".()_)C&%;)X_)`32.&1)).(,"0%,)&$)\".()_7)XQ);32.&17)#$1)U#+D+.8,,)%8)
_)
]9 ^.8,,)\".()Q)C&%;)X_)`32.&1)).(,"0%,)&$)\".()Q7)XQ);32.&17)#$1)U#+D+.8,,)%8)
Q9))
c9 ^.(#,()#)[&$()^.8,,)@$#03,&,7)2#,(1)8$)%;()d)8/)%;()6($84()/.84)\".()Q-)
\".()_-)ed)7)U#+D)_-)Qfd)X_gXQ-)fed7)U#+D)Q-)hfd7)\".()Q-)_eed)
)
U#+D+.8,,(,)1('&#%()/.84)%;()(F5(+%#%&8$)8/)#11&%&'&%39):;()2#+D+.8,,(,)088D)48.()
0&D()#)0#D()/&,;9)This-suggests-that-alleles-for-the-Lake-Type-are-dominant-over-the-
Stream-Type.-
)
Epistatic3variance3(VI):)'#.&#$+()#48$6)&$1&'&1"#0,)1"()%8)&$%(.#+%&8$,)2(%C(($)
1&//(.($%)08+&9):;&,)0(#1,)%8)#)'#.&(%3)8/)58,,&20()1('&#%&8$,)/.84)#11&%&'&%3)#$1)
184&$#$+(9))
)
R5&,%#,&,-)%;()&$%(.#+%&8$)8/)6($(,)%;#%)#.()$8%)#00(0(,7)&$)5#.%&+"0#.)%;(),"55.(,,&8$)
8/)%;()(//(+%)8/)8$(),"+;)6($()23)#$8%;(.9)
)
First,-look-for-results-to-an-additive-model-(Linear-Cross-Analysis).--
If-not,-then-look-to-a-dominant-model.--
If-not-again,-then-there-may-be-a-lot-of-epistatic-variance.)
)
• RF#450()C&%;)%;()K8#5)U(..3)2"6-)#)$(C)6801($)/."&%)%.(()C&%;),4#00(.)/."&%,)
,(0(+%(1)/8.),4#00(.)2(#D,9)[8$6)2(#D,)#.()#,,8+&#%(1)C&%;)%;()$#%&'()2#0088$)
'&$()/."&%9))
• U(#D)0($6%;),;8C,);"6()'#.&#%&8$))4",%)2()&$%(.#+%&8$)2(%C(($)08+&9)
)
Maternal3effects3variance3(VM):)'#.&#$+()#48$6)&$1&'&1"#0,)1"()%8)%;()5;($8%35()
8/)%;()48%;(.9)
)
*.#5;-)<8%;(.)8/)8$()585"0#%&8$)H_I)#$1)/#%;(.,)8/)%;(),(+8$1)HQI9)@$1)'&+()'(.,#9))
\".()^.8,,)\85-)/#%;(.)#$1)48%;(.)#.(),#4()%35()H_7_)8.)Q7QI9))
`32.&1-)48%;(.)/.84)(&%;(.)\85)_)8.)\85)Q7)#$1)/#%;(.,)%;()8558,&%()585"0#%&8$9)
K%.8$6)4#%(.$#0)(//(+%7)irrespective3of3the3genotype3of3the3fatheri):(00&$6)
38")%;#%)1&//(.($+()2(%C(($)%;()%C8)5".()%35(,)#.()1"()%8)8$03)4#%(.$#0)
(//(+%,9)
3
3
3
Maternal3effects3can3be3genetic3or3“plastic”:)*($8%35()8/)%;()48%;(.)+#$)
1(%(.4&$()%;()D&$1)8/)($'&.8$4($%)/8.)%;()8//,5.&$69)Y%)1(%(.4&$(,)%;(),"++(,,)8/)%;()
8//,5.&$69))
)
\0#,%&+-)$8%)6($(%&+9):;()48%;(.);#,)588.)$"%.&%&8$7).(6#.10(,,)8/)6($8%35(7)+#$)
+;#$6()%;()5;($8%35()8/)%;()8//,5.&$69)
)
Pure3environmental3variance3(VE):3`#.1)%8)="#$%&/37)(F+(5%)/8.),"2%.#+%&8$)/.84)
<9R9Z9Y9@)B)C;#%('(.)&,)0(/%)8'(.)C8"01)2()JR9)
3
Inheritance3of3quantitative3traits3
)
U.8#1O,($,();(.&%#2&0&%3-))
\.858.%&8$)8/)%;()5;($8%35&+)'#.&#$+()%;#%);#,)#)6($(%&+)2#,&,)8/)#$3),8.%-)
184&$#$+(7)(5&,%#%&+7)(%+9)
)
H2)G)J*)A)J\)H6($(%&+)'#.&#$+()A)%8%#0)5;($8%35&+)'#.&#$+(I)
K#3&$6)&%)&,)%;()5.858.%&8$)%8)#$3)8/)%;();(#1&$6,)"$1(.)J*)B)(#,3)%8)="#$%&/39)
)
O)`Q)+#$)'#.3)/.84)e)%8)_9e9)
)
L#..8C),($,();(.&%#2&0&%3-))
\.858.%&8$)8/)%;()5;($8%35&+)'#.&#$+()%;#%);#,)#$)#11&%&'()6($(%&+)2#,&,)
V(,(420#$+()2(%C(($)5#.($%,)#$1)8//,5.&$6)
Z84&$#$%)&$%(.#+%&8$,)#.()$8%)%.#$,4&%%(1)/"003)%8)%;(&.)8//,5.&$6)
)
h2)G)J@AJ\)H#11&%&'()'#.&#$+()A)%8%#0)5;($8%35&+)'#.&#$+(I)
;Q)&,)#),4#00(.)#48"$%)&/)38");#'()#$3)184&$#$%)8.)(5&,%#%&+)'#.&#$+()
5.(,($%9)
;Q)&,)%;()C#3)38")4#D()5.(1&+%&8$,)#28"%)('80"%&8$#.3)+;#$6()&$)#$3)
585"0#%&8$9)
)
R,%&4#%&$6)`(.&%#2&0&%3)
_9)V(,(420#$+()2(%C(($)5#%(.$#0);#0/O,&2,)
@)4#0()4#%(1)%8)%C8)1&//(.($%)/(4#0(,9)@'(.#6()%.#&%,)8/)4#0()%8)%;()/(4#0(,)
C&00)6&'()38")%;()#11&%&'()6($(%&+)'#.&#%&8$)8/)%;#%)4#0(9)^#0+"0#%()#'(.#6()
5;($8%35()#$1);8C)&%)1(%(.4&$(,)%;()%8%#0)'#.&#$+(9)
Q9)V(,(420#$+()2(%C(($)%C&$,))
[88D&$6)#%)/8,%(.)%C&$,)&$)1&//(.($%)($'&.8$4($%,9)@$1),((),&4&0#.&%&(,)C&%;)
%;8,()%C&$,)&$)1&//(.($%)($'&.8$4($%,9)K8)38")+#$),(()#11&%&'()6($(%&+)
1&//(.($+(,)C&%;);"4#$,),&$+()%;()($'&.8$4($%)C&00);#'()0&%%0()#//(+%)8$)%;(&.)
+8'#.&#$+()8/)6($(%&+,)#$1)($'&.8$4($%9)
]9)K085()8/)5#.($%A8//,5.&$6).(6.(,,&8$,)
[88D&$6)#%),085(,)8/)%;().(6.(,,&8$,)8/)%.#&%,)8/),#4(O,(F)5#.($%)#$1)
8//,5.&$69))
• @),%.8$6)+8..(0#%&8$)/8.)#)+08,().(6.(,,&8$7);Q)G)_7)4(#$&$6)%;()
8//,5.&$6j,)5;($8%35()&,)(F#+%03)(="#0)%8)%;()4&1O5#.($%)'#0"(9)HJ@)G)
J\I)
• @)/#&.)+8..(0#%&8$7);Q)G)e9f7)8$03)+#$)(F50#&$);#0/)%;()'#.&#$+()D$8C&$6)
%;()5#.($%#0)5;($8%35(,9)