Cheat Sheet for the Biology 151 Exam 2 – 10.docx

4 Pages
212 Views

Department
Biology
Course Code
BIOLOGY 151
Professor
Randy Phillis

This preview shows page 1. Sign up to view the full 4 pages of the document.
Description
Transcription To do transcription, the DNA strands have to be separated in order to provide a template and the  RNA polymerase then creates a new molecule using the base pairing rules and references the  template used prior. To build the RNA molecule you must have phosphodiester bonds using either the 5’ or 3’ base  pairs. RNA polymerase – separates the DNA strands and builds the phosphodiester bonds using the  base pairing rules. It will only make one strand! Combinatorial regulation or transcription Multiple transcription factors are required for gene expression Transcription factors activate or block gene expression in specific combinations DNA sequences of promoter regions of genes, and the presence of absence of specific  transcription factors determined by gene expression. Transcription Factors Transcription factors – positive regulators of DNA transcription they are sequence­specific  DNA binding proteins. Through the use of enhancers or silencers, they regulate gene expression  and transcription. Constitutive transcription factors – promote many different genes and do not seem to respond  to external signals Regulatory transcription factors – promotes a limited number of genes and responds to  external signals. RNA  ▯DNA RNA falls off of the DNA and stops transcribing by forming a structure called a stem loop.  Stem loop (palindrome) – the space between the two structures so that the base pairing  sequences are perfectly arranged. When this forms its interacts with RNA polymerase and causes  it to fall off of the DNA. (TRANSCRIPTION STOP SIGNAL) UTR – Un translated region, located in the RNA.  Upstream of the UTR – is not located in the UTR and downstream. RNA Processing 3’ hydroxyl – required to join nucleotides together in DNA 2’ hydroxyl – added into the loop in order to create 2 bases for the loop to form Exons – the coding regions of RNA normally located at the ends of the DNA strand/fragment.  (5’ to 3’)  During alternate RNA processing differing exons can be connected together to form a laureate  (loop). In order to block a particular exon a blocking site on a donor site on the introns is formed.  Then the snRNP moves downstream to the next donor site. Introns – the non­coding regions of RNA are located in between the exons and are eventually  removed from the fragment in order for the exon ends to be bound together and create a double  helix. (5’ to 3’) (A laureate is formed as the intron is being removed) Typically the intron being with the GT sequence and end with the AG sequence (the GT­AG rule) Splicing – mRNA processing removes the introns from the DNA fragment and splices or  attaches the exon ends together. SnRNPs – the editors of the RNA. They work by binding to the donor and accepting sites,  forming a laurite (double bend or loops) and splice out the intron site.  A special base called the A nucleotide, is responsible for this and joining together the exon ends.  Needs a special double phosphodiester bond that joins the two exons together By blocking acceptor sites, the donor site goes to the next one and acts like the one it skipped is  an intron and then it is removed. (Smaller mRNA) If the donor site is blocked, nothing is scanned for removal and then the intron never gets  removed (bigger mRNA) TATA box – at transcription start site that is 5’ – 3’ in nature and goes like: 5’­TATAWAW­3’ –  happens in transcription and allows transcription to happen. Ribosome binding site – is located in front of the stop codon in the 5’ UTR, which allows  protein to be made. Okazaki fragments – are joined together with DNA ligase and are at the end of the lagging  strands in RNA processing Protein Processing Protein is made of chains of amino acids that fold up and can act as many things such as  collagen, keratin, kinases, receptors etc. Amino acids (20 different ones) all have the same common cores, two abbreviations that are  either 3 letters or single letter code, which makes things easier for them. Four types of charges: basic – positively charge, or acidic – negatively charged, polar – positive  or negative charge, and non­polar –no charge given off – neutral. Bonded together with a peptide bond. Also they are formed from 5’ to 3’. Translation Translation  ­ making a sequence of amino acids in proteins by using the transfer RNA (tRNA)  through the use of messenger RNA (mRNA).  By using anticodons it allowed to make sure that  the translation is correct. Aminoacyl tRNA synthetase – is responsible for the correct matching of am
More Less
Unlock Document

Only page 1 are available for preview. Some parts have been intentionally blurred.

Unlock Document
You're Reading a Preview

Unlock to view full version

Unlock Document

Log In


OR

Join OneClass

Access over 10 million pages of study
documents for 1.3 million courses.

Sign up

Join to view


OR

By registering, I agree to the Terms and Privacy Policies
Already have an account?
Just a few more details

So we can recommend you notes for your school.

Reset Password

Please enter below the email address you registered with and we will send you a link to reset your password.

Add your courses

Get notes from the top students in your class.


Submit