Textbook Notes (369,205)
United States (206,227)
Biology (199)
BIOL 2299 (6)

Unit 6.docx

3 Pages

Course Code
BIOL 2299
Gail Begley

This preview shows page 1. Sign up to view the full 3 pages of the document.
Jonathan Olson Unit 6 28 September 2013 6.1 Phylogenies • Phylogenies reflect the patterns produces by evolution and reveal the evolutionary relationships of  organisms • Lineage – series of organisms connected by genetic information passed from one generation to the next o Can occur at many levels of biological organization • Nodes – points where one branch splits into two or more branches o Represents a common ancestor, or an ancestral population • Guide to reading a phylogeny 1. The position of the leaves on a phylogeny is not important: to understand relatedness, find the  common ancestor a. The nodes 2. A phylogeny can be flipped around any node without changing relationships • No species are alive today that are the ancestors of other living species • Systematics – the branch of biology concerned with the identification, classification, and naming of  organisms • Clade – all of the descendants of a common ancestor (node) on a tree 6.2 Constructing Phylogenetic Trees • Homologous traits – indicate common ancestry • Analogous traits – result from convergent evolution where similar adaptations are introduced in different  lineages • Cladistics – inferring phylogeny from homologous traits • Clade – a taxon, including a common ancestor and all of its descendants  o The ancestor can be one known to exist or may be speculator • Cladogram – a type of phylogenetic tree that shows only a pattern of branching o Branch lengths can but do not typically represent time or the relative amount of change in traits o Monophyletic – consists of the common ancestor and all of its descendants o Paraphyletic – refers to a sub portion of a clade that includes an ancestral species but not all of its  known descendants o Polyphyletic – includes species from multiple taxa with different ancestors o Are based on shared derived characters • Traits – those characters that are used to infer phylogeny • Shared ancestral characters – traits that organisms share with their common ancestors • Shared derived characters – characteristics that evolved in and are unique to a group or clade • To make a Cladogram, first the researcher must pinpoint an organism, species, or group of interest to be  studied as the ingroup o In addition, the researcher must identify for comparison an outgroup, which is a species or group  of species from a lineage that is known to have diverged before the lineage of the ingroup • Sometimes branch length matters, as they may be proportional to the amount of change and represent  the varying rates of change of a particular character among the different lineages • Maximum parsimony – The minimalist, problem­solving approach is rooted in ignoring unnecessary  info that just complicates the problem at hand o The investigator should first examine the simplest explanation that is consistent with the existing  information [Type text] [Type text] [Type text] • Maximum likelihood – certain probability rules about how gene sequences change over time enable the  construction of a tree that refle
More Less
Unlock Document

Only page 1 are available for preview. Some parts have been intentionally blurred.

Unlock Document
You're Reading a Preview

Unlock to view full version

Unlock Document

Log In


Join OneClass

Access over 10 million pages of study
documents for 1.3 million courses.

Sign up

Join to view


By registering, I agree to the Terms and Privacy Policies
Already have an account?
Just a few more details

So we can recommend you notes for your school.

Reset Password

Please enter below the email address you registered with and we will send you a link to reset your password.

Add your courses

Get notes from the top students in your class.