Class Notes (837,550)
United States (325,103)
Biology (196)
BIO-0013 (103)
Lecture

Bio 13 Lecture 33 Notes.docx

3 Pages
101 Views
Unlock Document

Department
Biology
Course
BIO-0013
Professor
Derek Mc Lachlin
Semester
Fall

Description
Lecture 33 Notes Western Blots • Like Northern blots, but that looks at proteins • Westerns look at proteins  o Technique for detecting specific antigens separated by electrophoresis by  use of labeled antibodies • Take a population of cells and isolate the protein in the cell o Run the proteins on a gel – thinner than agarose gel o Sorts out proteins in matrix by size • Transfer proteins to nitrocellulose membrane o Need energy for this transfer, not chemical reaction like Northern o Shoot some electricity into the gel being covered by cathods o End result is proteins on the membrane • Way to visualize proteins o Identify your protein of interest o Instead of using probe of nucleic acids, use an antibody from cells  Have a Y­shaped end o Antibody has sites where the protein of interest can join o Label the antibody fluorescently or radioactively  The protein should bind to that antibody o The antibody only binds to a specific protein – label makes it easy to  detect it o Wherever there is radioactivity, you’ll see a nice band  It will tell you whether the gene is expressed via protein meaning  the gene went all the way through translation Application of RNAinterference • microRNA interfere with the mRNA and fuck its shit up o Way of getting rid of RNA • Scientists can make synthetic silencing RNA  o Seeing if you can get rid of specific RNA messages to stop production of a  protein o Macular  degeneration – debilitating eye disease  Blood vessel growth in the eye when it doesn’t belong there  The synthetic silencing RNA targets the protein Vascular  Endothelial growth factor that promotes blood vessel growth o Scientists inserted the siRNA into the patients and the synthetic silencing  RNA actually reduced the blurriness and stuff Regulating Proteins • Ribosome moves in 5’ to 3’ direction – important!! • Protein folding o Really important in order for right parts of the protein to be seen by other  molecule  o Think about the ball of Christmas lights vs. organized Christmas lights  example o When a protein doesn’t fold properly  Doesn’t work properly • What regulates protein folding o In the 1950s, self assembly amino acid sequence is enough to fold the  protein o In the 1980s though molecule chaperone proteins were found – they are a  family of proteins that assist the correct non­covalent assembly of other  polypeptide­containing structures  Don’t assimilate into the final protein, just assist the folding o Chaperones  Very large family  Essential role in regulation of protein conformation states  Prevent incorrect interactions  Capture unfolded polypeptides, stabilize intermediates, and prevent  misfolded species from accumulating  Assist in transp
More Less

Related notes for BIO-0013

Log In


OR

Join OneClass

Access over 10 million pages of study
documents for 1.3 million courses.

Sign up

Join to view


OR

By registering, I agree to the Terms and Privacy Policies
Already have an account?
Just a few more details

So we can recommend you notes for your school.

Reset Password

Please enter below the email address you registered with and we will send you a link to reset your password.

Add your courses

Get notes from the top students in your class.


Submit